PCR 儀器有多種分類方法，具體如下：

一、根據(jù) DNA 擴增的目的和檢測標準分類

1、普通 PCR 儀：一次 PCR 擴增只能運行一個特定退火溫度，主要用于簡單的、對目的基因退火溫度的擴增，應用于科學研究、教學、醫(yī)學臨床、檢驗檢疫等機構。

2、梯度 PCR 儀：一次性 PCR 擴增可設置一系列不同的退火溫度條件，通常有 12 種溫度梯度，用于研究未知 DNA 退火溫度的擴增，可節(jié)約成本和時間，也可在不設置梯度時當作普通 PCR 儀使用，多應用于科研、教學機構。

3、原位 PCR 儀：用于從細胞內(nèi)靶 DNA 的定位分析，可保持細胞或組織的完整性，使 PCR 反應體系滲透到組織和細胞中，在細胞的靶 DNA 所在位置進行基因擴增，對于在分子和細胞水平上研究疾病的發(fā)病機理、臨床過程及病理轉變有重大實用價值，主要應用于臨床、科研領域。

4、實時熒光定量 PCR 儀：在普通 PCR 儀基礎上增加了熒光信號采集系統(tǒng)和計算機分析處理系統(tǒng)，PCR 擴增時加入的引物利用同位素、熒光素等進行標記，使用引物和熒光探針同時與模板特異性結合擴增，擴增結果通過熒光信號采集系統(tǒng)實時采集信號并輸送到計算機分析處理系統(tǒng)，得出量化的實時結果輸出，主要用于醫(yī)學臨床檢測、生物醫(yī)藥研發(fā)、食品行業(yè)、科研院校等機構。

二、根據(jù) DNA 擴增時升溫介質(zhì)分類

1、變溫鋁塊式 PCR 儀：以電阻絲、導電熱膜、熱泵式珀爾帖半導體元件等為熱源，通過升溫帶有凹孔的鋁塊，利用自來水、制冷壓縮機或半導體來降溫。優(yōu)點是溫度傳導快，各管擴增一致性好；缺點是壓縮機制冷重量大、啟動慢等。實時熒光定量 PCR 儀

2、水浴式 PCR 儀：以水為傳熱介質(zhì)，通過機械裝置將帶有反應管的架子在 3 個不同溫度的水浴中移位和升降溫度，實現(xiàn)溫度循環(huán)。優(yōu)點是溫度易恒定，熱容量大，擴增效果穩(wěn)定；缺點是高溫水浴不穩(wěn)定，改變水浴溫度耗時較長。

3、變溫式流式 PCR 儀：依據(jù)空氣流的動力學原理，以冷熱氣流為介質(zhì)升降溫度。優(yōu)點是變溫迅速，適合微量、快速 PCR，反應器不受形狀限制；缺點是難以控制低溫，有較多空氣流動力學要求。

三、根據(jù)實時熒光定量 PCR 儀的結構分類

1、金屬板式實時定量 PCR 儀：可作為普通 PCR 儀使用，部分帶梯度功能，能容納的樣本量大，無需特殊耗材，但溫度均一性欠佳，存在邊緣效應，標準曲線的反應條件難以與樣品一致。

2、離心式實時定量 PCR 儀：PCR 擴增樣品槽被設計為離心轉子，溫度均一性好，使用同一個激發(fā)光源和檢測器，可隨時檢測旋轉到跟前的樣品，能有效減少系統(tǒng)誤差，但可容納樣品量少，有的需用特殊毛細管作樣品管，增加了使用成本，且不帶梯度功能。

3、各孔獨立控溫的定量 PCR 儀：不同樣品槽分別擁有獨立的智能升降溫模塊，各孔獨立控溫，適合多指標快速檢測，可實現(xiàn)任意梯度反應，但上樣不如傳統(tǒng)方法方便，且需要特殊的扁平反應管，使用成本較高。

PCR儀器種類多樣，選擇時需根據(jù)實驗需求、通量和預算進行權衡。