這是一個非常常見且重要的選擇。Qubit 4.0 和 NanoDrop One 是功能互補而非相互替代的儀器。選擇哪一個（或者更常見的：是否需要兩者）取決于您的實驗對核酸/蛋白定量準確性的要求。

簡單來說：

NanoDrop One：用于快速評估樣品的濃度和純度（通過A260/A280等比值），但準確性相對較低，尤其對于低濃度樣品。

Qubit 4.0：用于高度精準、特異地測量特定類型核酸的濃度，但對純度信息有限，且通量較低。

下面我將從多個維度進行詳細對比，并給出最終建議。

一、根據您的應用場景

1、選擇 NanoDrop One 更適合您，如果：

需要快速評估純度：您想快速知道樣品中是否有蛋白質（A260/A280）、鹽或有機溶劑（A260/A230）污染。這是NanoDrop優勢。

樣品量充足且濃度較高：例如常規的質粒DNA提取、PCR產物純化后檢測。

預算有限或想控制耗材成本：不需要持續購買昂貴的檢測試劑。

進行定性或半定量分析：例如看看樣品“有沒有"以及“大概多少"。

2、選擇 Qubit 4.0 更適合您，如果：

進行高度依賴精確濃度的下游應用：

下一代測序（NGS）：這是必須使用Qubit的領域。NGS文庫定量要求極精確，任何污染物或不準確定量都會導致數據量不均或測序失敗。

實時熒光定量PCR（qPCR）：準確定量模板DNA/cDNA是獲得準確Ct值的前提。

克隆：需要精確知道插入片段和載體的比例。

樣品珍貴或濃度很低：例如從稀有樣本中提取的DNA、ChIP后的DNA、單細胞RNA等。Qubit的靈敏度遠超NanoDrop。

樣品成分復雜：樣品中可能含有雜質，如鹽、蛋白、去污劑、RNA或另一種核酸（如同時有DNA和RNA），您需要特異性地只測量其中一種。

二、典型的工作流程

1、首先：NanoDrop快速篩查

提取核酸后，先用NanoDrop測量。

看濃度：獲得一個大概的濃度范圍。

看純度：檢查A260/A280和A260/A230比值是否在理想范圍內（如1.8-2.0和2.0-2.2）。如果比值異常，說明樣品不純，可能需要重新純化，甚至沒有必要進行下一步精確定量。

2、第二步：Qubit精準定量

對于通過純度檢查的、要用于關鍵下游實驗（如NGS、qPCR）的樣品，再用Qubit進行最終的精確定量。

確保加到下游反應中的每一個樣品的量都是準確的。

三、最終建議

如果你的預算只允許買一臺，且實驗要求不高：先從 NanoDrop One 開始。它可以滿足大部分教學、本科實驗和常規分子生物學實驗的初步篩查需求。

如果你從事嚴格依賴精確定量的研究（如NGS）：Qubit 4.0 是必需品。你甚至可能需要先買Qubit。

理想情況：兩者都配備。先用NanoDrop檢查純度并獲得粗略濃度，再用Qubit對關鍵樣品進行精確定量。這是目前絕大多數科研實驗室的黃金標準。

總結：NanoDrop是“普查工具"，快速且能提供純度信息；Qubit是“精準工具"，為關鍵步驟提供可靠數據。請根據您的具體應用和預算做出選擇。