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伯樂(Bio-Rad)CFX Opus Deepwell實時熒光定量PCR儀的操作方法。這是一套標準、通用的操作流程,適用于大多數實驗。請務必始終參考您實驗室的具體SOP(標準操作程序)和試劑盒說明書,因為不同實驗的細節可能有所不同。
一、CFX Opus DeepWell實時熒光定量PCR儀操作步驟詳解
整個操作流程可以概括為以下四個主要階段,CFX Maestro軟件也基本按照這個邏輯引導用戶:
1、創建實驗方案
(1)在CFX Maestro主界面,點擊 “新建實驗" 或 “創建新實驗"。
(2)設定實驗類型: 選擇“定量PCR"。
(3)編輯實驗方案:
反應體積: 輸入您的反應體系總體積(例如 20 µL)。
孵育溫度:
預變性: 通常為95°C,持續30秒到3分鐘(根據預混液說明書推薦)。
PCR循環(擴增):
變性: 通常是95°C,持續10-15秒。
退火/延伸: 通常是60°C,持續30-60秒。在此步驟收集熒光信號。循環次數通常設為40-45個循環。
熔解曲線(可選): 如果您的實驗需要(例如使用SYBR Green染料),勾選此選項。儀器會在PCR結束后自動運行熔解曲線程序,通常從65°C緩慢升溫到95°C,并持續監測熒光變化。
(4)選擇熒光染料/探針:
點擊“檢測"或“通道"設置。
根據您使用的熒光物質,選擇相應的檢測通道(例如,FAM, HEX/VIC, ROX, Cy5等)。ROX通常被用作參考染料,用于校正孔間誤差。
為每個通道指定其檢測的目標基因。
(5)保存此方案,可以為其命名以便后續調用。
2、第二步:設置板布局
(1)軟件會顯示一個虛擬的96孔板界面。
(2)分配樣品和目標:
用鼠標選中孔或一個區域,然后在右側面板進行設置。
樣品類型: 為每個孔選擇“未知"、“標準品"、“陽性對照"或“陰性對照"。
目標: 從下拉菜單中選擇該孔檢測的基因名稱(對應之前設置的熒光通道)。
樣品名稱: 輸入有意義的名稱以便識別(例如,“Patient_1", “Std_1e6")。
對于標準品,您需要輸入準確的初始模板濃度(例如,1,000,000 copies/µL),軟件將根據這些點自動生成標準曲線。
(3)完成所有孔的設置后,板布局會以顏色和文字清晰顯示。
3、第三步:運行前準備與上樣
(1)準備反應體系:
在超凈工作臺或冰上,按照您的實驗方案配制qPCR反應混合液。通常是將預混液、引物/探針、水和模板DNA/cDNA混合。
重要: 避免產生氣泡,氣泡會干擾光路和熒光信號。
將配制好的反應液分裝到qPCR反應板的各個孔中。
(2)封板:
使用光學封板膜覆蓋板面。確保封板膜平整、緊密地貼在板子上,沒有褶皺和氣泡。這是防止蒸發和污染的關鍵步驟。
(3)上樣:
輕輕將反應板放入CFX Opus儀器的樣品槽中。
注意方向: 確保板的A1孔位于儀器的左前方(通常有角標或圖示指示)。
關閉儀器門,聽到鎖扣聲確保關緊。
4、第四步:啟動運行
回到CFX Maestro軟件界面,檢查所有設置無誤。
點擊 “開始運行" 按鈕。
軟件會彈出一個最終確認對話框,顯示預計運行時間。確認后,點擊“開始"。
儀器將開始運行您設定的溫控程序,并實時采集熒光數據。您可以在軟件界面上實時查看擴增曲線和熒光信號的變化。
二、CFX Opus DeepWell實時熒光定量PCR儀運行后數據分析
1、查看結果:
(1)擴增曲線圖: 查看所有孔的擴增曲線是否正常(S型曲線),陰性對照有無擴增。
(2)標準曲線: 如果設置了標準品,軟件會自動給出標準曲線,并顯示其斜率、效率和R2值。理想的斜率在-3.3左右,效率接近100%,R2 > 0.99。
(3)Ct值: 軟件會為每個孔計算Ct值(閾值循環數)。
(4)熔解曲線(如果運行了): 查看熔解峰是否單一,以確認SYBR Green實驗的特異性。
2、數據導出:
您可以將Ct值、濃度結果、擴增曲線圖等導出為Excel或PDF格式,用于進一步處理和報告撰寫。
三、重要注意事項
1、安全重要性: 在清潔或發生泄漏時,請務必關閉儀器電源并拔掉插頭。
2、防污染: 始終使用帶濾芯的吸頭,并在專門區域配制反應體系,以防止氣溶膠污染。
3、規范操作: 操作光學封板膜和反應板時,請佩戴手套,避免用手直接接觸表面,以免影響光學讀數。
4、儀器維護: 定期根據手冊對儀器進行清潔和維護。如果樣品發生泄漏,必須立即清潔樣品槽。
5、尋求幫助: 如果遇到任何儀器報警或異常結果,請首先參考用戶手冊,或聯系伯樂的技術支持。